Svätý Otec pre hospitalizáciu v nemocnici nemal v nedeľu 11. júna tradičný poludňajší príhovor a Anjel Pána sa pomodlil v súkromí. Ešte pred plánovanou operáciou sa stretol s účastníkmi a organizátormi festivalu Green&Blue, ktorý sa konal pri príležitosti Svetového dňa životného prostredia.
Pápež podstúpil v stredu 7. júna v nemocnici Gemelli trojhodinovú operáciu brušnej dutiny. Prebehla bez komplikácií a Svätý Otec sa zotavuje. Do 18. júna však pozastavili všetky pápežské audiencie.